研究所以国际著名的美国哈佛大学威尔曼激光医学联合实验室(Wellman Laboratories of Photo-medicine)和美国加州大学贝克曼激光医学研究所及临床应用中心(Beckman Laser Institute and Medical Clinics)的运行理念为模式,将教学、科研、人才培养、科研成果转化与临床激光医院相结合,促进我国激光医学及生物光子医学的研究和发展,为激光与光电子技术在医学各个领域的研究与应用提供一个高水准的,集科学研究、技术开发、科技服务、国际合作为一体的技术平台,成为推动激光医学的创新与产业化发展的知识源泉与科技动力。目前研究所已与包括:德国海德堡大学、约翰.霍普金斯大学、美国哈佛大学、加州大学尔湾分校等世界著名大学均建立了良好的合作关系。等多所国际知名大学建立了合作关系。每年研究所派出一批研究生赴德国和美国进行联合培养与科研交流。